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檔案商調函和調檔函的區別如下：
1、公司有保管檔案的資格，開的是商調函。
2、人社局下屬的人才市場調檔案開的是調檔函。
3、平級單位調動檔案是調檔函，下級單位向上級單位調動檔案是商調函。
4、格式不一樣，只有國家事業單位之間調動才用調檔函，如果是企業或人才市場之間一般用商調函。
5、身份不同。有干部身份的開商調函，沒有干部身份的開調檔函。
兩者應該沒有實際差別商調函是指沒有隸屬關系的地區，人力資源的流動有嚴格的手續，產生于高度計劃體制下的人事管理制度、部門或國有單位之間為了人才流動而互致的公文。調檔函便是這諸多嚴格手續中的一道，可能只有國家事業單位之間調動才用調檔函，格式不一樣。此制度與術語在當前國家機關與事業單位間仍然沿用。
