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1、遺傳因子：基因的最初概念來自孟德爾的“遺傳因子”，認為生物性狀的遺傳是由遺傳因子所控制的，性狀本身是不能遺傳的，被遺傳的是遺傳因子。
2、基因是一個遺傳、交換、突變的單位：1910年摩爾根等通過果蠅雜交實驗表明，染色體在細胞分裂時的行為與基因行為一致，從而證明基因位于染色體上，并呈直線排列，提出了遺傳學的連鎖交換規律，證明了性別決定是受染色體支配的。
3、基因是不可分割的功能單位：1944年Avery等人我生物化學方法證明了DNA就是遺傳物質。G W．Beadle和E．L．Tatum通過對粗糙脈孢菌營養缺陷型的研究，提出了一個基因一個酶的假說。
4、基因是一個轉錄單位：50年代初，美國遺傳學家B．McClintock在玉米的控制因子的研究中已經指出某些遺傳因子是可以轉移位置的。
