1、無法辦理房產證：有的回遷房，政府是不允許買賣的，有的能買賣，因此在購買此類房屋前，要了解清楚該房屋能否買賣。若是購買了不能買賣的房屋，那購買方是不能辦理房產證的，更不可以把該房屋過戶到自己的名下，另外也不能對該房屋進行轉讓、貸款等等。

2、易發生產權糾紛：若是該回遷房在出售后，房價上漲了許多，有部分出賣人便會感到后悔，想要反悔。有的出賣人會違約，會主張出售合同無效，那購買者就容易出現財產損失。尤其是所買的回遷房是不可轉讓買賣的，在這種情況下，購買方就難以保證自身權益。

3、居住安全難以保證：對于回遷房，有的業主會選擇自住，也有的業主會選擇出租、出售，這樣在回遷樓中，流動人口就多，居住的安全性就較低，另外在物業、消防、衛生等方面都多少有一些的隱患。