經(jīng)教育部批準，目前擁有研究生院的南京高校只有如下6所：南京大學(xué)（985 211 綜合類）、東南大學(xué)（985 211 綜合類）、南京理工大學(xué)（國防985 211 工科類）、南京航空航天大學(xué)（國防985 211 工科類）、河海大學(xué)（211 工科類）、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)（211 農(nóng)業(yè)類）。而南京財經(jīng)大學(xué)（財經(jīng)類）雖然沒有研究生院也不是211工程院校，但是在經(jīng)濟學(xué)方面較突出。一般情況下，以上七所學(xué)校在經(jīng)濟學(xué)上若分三檔，則第一檔高校：南京大學(xué)；第二檔高校：東南大學(xué)、南京財經(jīng)大學(xué)、南京理工大學(xué)、南京航天航空大學(xué)；第三檔高校：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、河海大學(xué)。由于各大學(xué)的強勢專業(yè)不同，其根據(jù)不同專業(yè)的大學(xué)排名也有所不同。