1、放款速度慢：由于組合貸款涉及商業銀行、住房公積金管理中心、擔保公司等多個機構，辦理周期通常需要兩三個月，甚至更長。所以貸款前最好咨詢一下開發商，他們可能會拒絕你使用組合貸款。如果購買二手房，還要看房東是否接受組合貸款并愿意等待。

2、必須兩者同時放款：由于公積金和商業貸款審批部門不同，所以需要兩個部門均審批通過才可放款，合同中所約定的放款時間一般是買賣雙方約定，與公積金中心無關，公積金中心對此不承擔責任。

3、利率并不一定比純商貸低：純商貸通?？梢源?.5折，以后就算基準利率有變化，這樣的折扣也不會改變，相反，組合貸中商貸部分上浮卻是具有永久屬性的。

4、必須同一家銀行：申請組合貸款時，必須在同一家銀行辦理公積金貸款與商業貸款，而且還要到指定的銀行辦理，而且需要同時符合商業貸款與住房公積金貸款的政策要求，否則首付比例和貸款利率標準都會有所上浮。