九尾入侵木葉是在《火影忍者》的第468集和第469集，雖然九尾是一切故事的開端，但直到鳴人的媽媽出現，向他說起16年前的往事，這一場景才真正完全呈現在觀眾面前，鳴人的父親就是因九尾而死，鳴人的命運也因九尾而改變。

上古時期，有一顆神樹，它的查克拉被奪走之后，便幻化成了破壞力極強的十尾，為了阻止十尾繼續作惡，六道仙人將它封印，并將十尾的查克拉分為九份，成為九只尾獸，九尾就是其中之一，也是最厲害的一只尾獸。

六道仙人死后，九尾破壞了很多村莊，使眾人流離失所，后來它被宇智波斑收服，初代火影的妻子漩渦水戶把九尾封印在了自己體內，她死后，九尾又被封印在了漩渦玖辛奈體內，但在漩渦玖辛奈分娩時，一個神秘的面具男打開封印放出了九尾。

這個面具男就是宇智波帶土，他將九尾放出，就是希望九尾繼續危害人間，以便達成自己不可告人的目的，那時火影已經傳給了波風水門，他是第四代火影，也是鳴人的父親，他將九尾封印在了鳴人體內，自己卻因使用尸鬼封盡而犧牲。

鳴人小小年紀便失去父母，還因為體內被封印了九尾而遭眾人嫌棄，在成長過程中，鳴人有好幾次都因控制不住九尾的力量而獸化，他和九尾也一直處于敵對狀態，但隨著時間的推移，他們在相處過程中逐漸理解了對方。

最終鳴人和九尾成為好朋友，在九尾的幫助下，鳴人成為完美人柱力，在與佐助的決戰中，九尾將所有的查克拉都給了鳴人，從此陷入沉睡，不過在劇場版中，九尾不僅成功蘇醒，還恢復了從前的力量。