1、去腥。生蠔是常見的海鮮品種，本身是有著一定的腥味，一般人估計是不太受得了。如果用比較原汁原味的吃法，不加過多的辣椒、蔥姜蒜等，腥味會比較重，而檸檬中含有豐富的芳香類化合物，可以遮蓋生蠔的腥味，并且檸檬的味道比較單薄，不會遮蓋生蠔本身的味道。

2、殺菌。生蠔當中具有的營養物質種類是比較多種的，其含有豐富的蛋白質、不飽和脂肪酸等成分，這些成分是細菌良好的培養基，保存過程中易滋生細菌，而檸檬中含有豐富的檸檬酸、蘋果酸等酸性成分，有一定的殺菌作用，因此在生蠔上加一些檸檬可以避免生蠔中的細菌導致身體不適。

3、保持營養。吃生蠔時加檸檬還具有保持營養的好處，由于生蠔中含有的不飽和脂肪酸是一種易氧化的成分，會在烹飪或者放置過程中生成一些飽和脂肪酸，降低了生蠔中的營養價值，而檸檬中含有豐富的維生素C，抗氧化性極強，因此將檸檬和生蠔一起食用可以保持生蠔中的營養價值。