現(xiàn)行的新型農(nóng)村合作醫(yī)療的報(bào)銷期限為一年，次年即作廢，因此必須在次年1月底前結(jié)清，超過(guò)規(guī)定期限的，醫(yī)保部門是不予報(bào)銷的。對(duì)于異地結(jié)算的新農(nóng)合，一般需要在3個(gè)月內(nèi)結(jié)算清楚，如遇特殊情況，經(jīng)鄉(xiāng)、鎮(zhèn)部門證明后可延至次年2月底結(jié)清，逾期不再辦理報(bào)銷手續(xù)，因此，無(wú)論什么情況，盡早報(bào)銷都是比較好的。

法律依據(jù)：《關(guān)于加快推進(jìn)新型農(nóng)村合作醫(yī)療試點(diǎn)工作的通知》各地要認(rèn)真總結(jié)試點(diǎn)單位的好做法，積極進(jìn)行農(nóng)民個(gè)人繳費(fèi)方式的探索，充分發(fā)揮基層組織的作用，建立穩(wěn)定的籌資機(jī)制。如果農(nóng)民個(gè)人自愿，經(jīng)村民代表大會(huì)討論同意，可以由村民自治組織代為收繳農(nóng)民的個(gè)人繳費(fèi)。要加強(qiáng)基金管理，做到專戶儲(chǔ)存，專款專用，嚴(yán)格實(shí)行基金封閉運(yùn)行，確保合作醫(yī)療基金和利息全部用于參合農(nóng)民的醫(yī)療補(bǔ)助。