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南京農業大學在校本科生在完成大學一年級課程，進入二年級之前，符合以下條件之一者，即可申請轉專業：
1、在某一學科方面確有特長的學生；
2、因為身體健康原因，經學校指定的醫療單位檢查證明不能在原專業學、但尚能在本校其他專業學習者；
3、通過轉專業能有利于學生自主學習成材，且參加學校的選拔，選拔合格者。
轉專業申請時間和申辦程序：
1、學生轉專業每學年集中審批一次，申請時間在每學年第二學期的最后兩周；
2、教務處于每學年第二學期末，根據轉入專業的辦學條件，分文、理科向全校公布轉入專業的接受名額；
3、學生本人向所在學院提出申請并填寫《轉專業申請表》，由學院審核同意后統一報教務處。
