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有實驗表明，痢疾桿菌可在醬油中生存2天，副傷寒桿菌、沙門氏菌、致病性大腸桿菌能生存23天，傷寒桿菌可生存29天。還有研究發現，醬油中有一種嗜鹽菌，一般能存活47天。人一旦吃了含有嗜鹽菌的醬油，可能出現惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉等癥狀，嚴重者還會脫水、休克，甚至危及生命。雖然這種情況比較少見，但為了安全著想，醬油最好還是熟吃，加熱后一般都能將這些細菌殺死。
盡管醬油的營養價值很高，含有多達17種氨基酸，還有各種B族維生素和一定量的鈣、磷、鐵等，但它的含鹽量較高，平時最好不要多吃。
