《神奇寶貝》甲賀忍蛙在第七集中進(jìn)化的，忍者村發(fā)生了叛亂，小智一伙人隨之被卷入其中，叛忍的頭目景友想要抓住忍者村的頭領(lǐng)半藏，逼他讓位。

忍者村為了奪回首領(lǐng)，展開(kāi)了戰(zhàn)斗，小智為了好友三平?jīng)Q定加入這支戰(zhàn)斗隊(duì)伍。

在前進(jìn)的路上，他們遇到了強(qiáng)敵兵太夫，兵太夫使用的劈斬司令曾經(jīng)打敗過(guò)小智的呱頭蛙和皮卡丘，小智不想自己連續(xù)輸在兵太夫手中兩次，于是使用了呱頭蛙、皮卡丘和三平的甲賀忍蛙三只神奇寶貝一起攻擊劈斬司令。

但是還是打不過(guò)對(duì)方，皮卡丘受到的傷害最多，很快倒地不起，非常可憐。

劈斬司令并不就此停手，兵太夫也看出了皮卡丘的潛力，讓劈斬司令乘勝追擊，對(duì)皮卡丘進(jìn)行殘忍的攻擊。三平的甲賀忍蛙已沒(méi)有戰(zhàn)斗力，就躺在皮卡丘身邊，為了保護(hù)同伴，它吃力地爬起來(lái)，用手刀擋住了劈斬司令的影子鉤。

在這個(gè)時(shí)候，進(jìn)化之光來(lái)了，呱頭蛙完成了最終進(jìn)化，成了忍者賀蛙。