原因如下：

1、可可西里東部與西北部及長江源區的地理、氣候條件不同。西部湖泊眾多，是長江北源楚瑪爾河的發源地區，大小河流縱橫交錯，植物生長不均勻。東部海拔較高，而三江源保護區的海拔相對較低，氣候環境溫暖舒適，母羚羊更喜歡生活在海拔相對較低的地方。因此，母羚羊為了明確的方向性寧愿長距離遷徙。

2、遷徙路線與河道有關，藏羚羊喜歡在楚瑪爾河兩岸活動。楚瑪爾河橫貫可可西里的中、北部，有近一半的河段在青藏公路以東，是一條季節性河流。

3、由于前些年西北部大量產羔期的藏羚羊被獵殺，迫使藏羚羊向東轉移而越過公路去棲居。但青藏公路日漸密集的車輛形成一道流動屏障，藏羚羊很難穿越。除了采礦、采油等干擾外，2002年進青藏的建設人員就有10萬左右。10年前格爾木還只是一個人類聚居點，而現在已是相當繁華的城市。人流的涌入或許并未充分考慮該地區的生態承受能力和對野生動物生存的影響。