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1、目的不同：軍事院校指揮類專業主要是為軍隊培養基層指揮軍官，學員畢業后，絕大多數都是分配到各戰區、各軍種部隊的基層單位擔任排長、連長、指導員、參謀等職授予中尉軍銜。
軍事院校非指揮類專業也稱為技術專業，主要為軍隊培養初級專業技術人員，比如軍醫、軍械、通信等專業，這些學員畢業后，基本上分配到科研單位、軍隊事院校、技術保障部門，身份為專業技術軍官，也是授予中尉軍銜。
2、要求不同：指揮類專業對學員在身體素質、個人氣質、文化基礎、政治素養方面都有較高的要求。這些初級軍官不僅要了解基本武器和裝備的使用，還有了解怎么帶兵，怎么管理，怎么組織和指揮。所以軍隊指揮專業要求這些學員要有強健的體魄，良好的耐心，較強的責任心，和優秀的指揮才能；非指揮類專業對學員的文化基礎要求都比較高，要具有扎實的知識基礎，和較強的科研能力。
3、升遷（前途）不同：指揮軍官初期晉升較快，但晉升的空間有限，而且很難在部隊長久發展。而專業技術人員初期晉升較慢，但晉升的空間較大，而且相對在部隊發展的時間較長。
