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1、成分不同：碘酒的主要成分是碘、碘化鉀；而碘伏是單質碘和聚乙烯呲咯烷酮的不定性結合物。
2、顏色不同：碘酒是呈紅棕色的液體；而醫用碘伏通常濃度較低，呈淺棕色。
3、價格不同：碘酒使用時需要酒精脫碘，所以碘酒的價格相對便宜；而碘伏為絡合碘，使用時不用酒精脫碘，價格稍貴。
4、溶媒不同：碘酒是以乙醇為溶媒的；而碘伏是以水為溶媒。
5、效果不同：碘酒的消毒能力和腐蝕能力都比碘伏要強。
6、刺激性不同：由于碘酒的腐蝕性和刺激性很大，傷口遇到碘酒就會非常疼痛，而碘伏就相對來說比較溫和。
7、傷害性不同：使用碘酒可能會破壞正常的組織從而使得傷口恢復緩慢，但是碘伏的傷害小，所以一般不會留下傷疤。
