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質粒載體、噬菌體載體、黏粒載體、YAC、BAC等等。
所有的質粒載體都有三個共同的特征:一個復制子、一個選擇性標志和一個克隆位點。復制子是含有DNA復制起始位點的一段DNA,也包括表達由質粒編碼的復制必需的RNA和蛋白質的基因。選擇性標志對于質粒在細胞內持續存在時必不可少的。克隆位點是限制性內切酶切割位點,外源性DNA可由此插入質粒內,而且并不影響質粒的復制能力,或為宿主提供選擇性表型。
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