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三教合一和三教并行區別為：主次不同、追求目標不同、階段不同。
一、主次不同
1、三教合一：三教合一以儒學為主，調和并吸收佛教、道教理論。
2、三教并行：三教并行的沒有主次之分，儒、釋、道三教地位平等。
二、追求目標不同
1、三教合一：三教合一的追求目標唯一，為入世。
2、三教并行：三教并行的追求目標不唯一，為出世、游世和入世。
三、階段不同
1、三教合一：三教合一處于最后的階段，彼此內在意識上的流通融合，逐步變成你中有我，我中有你。
2、三教并行：三教并行處于最初的階段，雖然有三教的連稱，不過彼此是獨立的。
