常見方法如下：

1、地面堆碼貯藏。

選用沒有直射光、空氣流通，土質或紅磚地面的空屋作貯藏室。地面墊5厘米厚稻草或麥秸，將老熟、無損傷南瓜堆上。堆放時，保持南瓜挨著地面的方向向下，瓜蒂朝里瓜頂向外碼成圓錐形。每堆15至20個，大型瓜不要堆得太多，防止擠壓，有利于通風。初期夜間開窗通風換氣，白天關閉遮陽，保持室內空氣新鮮、干燥和涼爽；冬季關閉門窗防寒即可；

2、架式分層貯藏。

貯藏室內用竹木或角鐵搭成分層貯藏架，每層高度比南瓜高8至10厘米。每層貯藏架上鋪5厘米厚稻草或麥秸。南瓜擺放狀態與堆藏相同，架式分層貯藏效果優于地面貯藏。

3、地窖低溫貯藏。

地上鋪墊5厘米厚的細沙或麥秸、稻草，堆放2至3層瓜；也可搭架子將南瓜放在架子上。窖內溫度控制在10℃左右，相對濕度保持70%至80%。貯藏前要注意選好南瓜，適期采收，不能遭受霜打，瓜蒂處保留5厘米長的瓜梗，防止機械損傷即可。