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北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部學(xué)科覆蓋基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、護理學(xué)等六大門類。其開設(shè)的專業(yè)有：生理學(xué)與病理生理學(xué)系、病理學(xué)系、醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)系、解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)系、藥事管理與臨床藥學(xué)系、分子與細胞藥理學(xué)系、勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學(xué)系等等。
北大醫(yī)學(xué)部有專門的口腔學(xué)院，包含眾多口腔系專業(yè)。
