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菏澤學院是綜合性獨立學院，專業有很多，分為四大學部，其中是經濟學部，管理學部，人文學部，信息學部，具體部門專業介紹如下：
1、經濟學部包括的專業有經濟學專業、金融學專業、財政學專業、國際經濟與貿易學專業、保險學專業、統計學專業；
2、管理學部包括的專業有會計學專業、工商管理專業、人力資源管理專業、財務管理專業、市場營銷專業、旅游管理專業、電子商務專業、公共事業管理專業、勞動與社會保障專業；
3、信息學部包括電子信息科學與技術專業、光信息科學與技術專業、電氣信息類專業、電子科學與技術專業、土木工程專業、信息管理與信息系統專業；
4、人文學部包括漢語言文學專業、對外漢語專業、法學專業、政治學與行政學專業、新聞學專業、廣告學專業。
