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1、科屬區別。穿山甲：為動物界、脊索動物門、脊椎動物亞門、哺乳綱、真獸亞綱、鱗甲目、穿山甲科、穿山甲屬地棲性哺乳動物；食蟻獸：食蟻獸為動物界、脊索動物門、脊椎動物亞門、哺乳綱、披毛目、食蟻獸科哺乳動物。
2、形態區別。穿山甲：體形狹長，全身有鱗甲，四肢粗短，尾扁平而長，背面略隆起，頭呈圓錐狀，眼小，吻尖，舌長，無齒，耳不發達，足具5趾，并有強爪，前足爪長，全身鱗甲如瓦狀，自額頂部至背、四肢外側、尾背腹面都有，鱗甲從背脊中央向兩側排列，呈縱列狀，鱗片呈黑褐色，絨毛極少；食蟻獸：食蟻獸吻部尖長，嘴管形，舌可伸縮，并富有粘液，適于舐食昆蟲，耳小而圓，前肢力強，第三指具特別發達并呈鐮刀狀的鉤爪，后肢4-5趾亦具爪。頭骨細長而脆弱，無齒。
3、分布區別。穿山甲：生活在山麓地帶的草叢中或較潮濕的丘陵雜灌叢，挖洞居住，多筑洞于泥土地帶，主要分布于東南亞及非洲的部分國家；食蟻獸：侏食蟻獸樹棲，大食蟻獸主要棲于潮濕的森林和沼澤地帶，小食蟻獸日間多隱蔽在密林或躲在樹洞里，夜間出來覓食，常用前肢爪搗毀蟻巢，主要分布于中美洲和南美洲從墨西哥最南端到巴西、巴拉圭的廣大地區。
4、食性區別。穿山甲：其主要食物為白蟻，此外也食蟻及其幼蟲、蜜蜂、胡蜂和其它昆蟲幼蟲等，食量很大，一只成年穿山甲的胃，最多可以容納500克白蟻；食蟻獸：食蟻獸吃螞蟻、白蟻及其他昆蟲，舌頭能驚人地伸到60厘米長，并能以一分鐘150次的頻率伸縮，舌頭上遍布小刺并有大量的粘液，螞蟻被粘住后將無法逃脫，食量很大，一次可食454克重的螞蟻。
