1、圈舍消毒：要求半月到一月消毒一次，用百分之十的漂白粉溶液，百分之二十的生石灰水溶液，百分之2-4的火堿溶液，百分之0.5-3的過氧乙酸溶液，分別對圈舍的地面、墻壁、頂棚等進行噴灑，用量為每平方米在1500-2000毫升以上。在圈舍的出入口處要鋪設草墊或者麻袋片，上面分別噴灑百分之2-4的火堿溶液（用于病毒性疾病），百分之10的克遼林溶液（用于其他疾病）。

2、器具消毒：包括常用設備、食槽、車輛等，可用百分之10的漂白粉溶液進行消毒處理。

3、羊體消毒：在高溫天氣，可用百分之十漂白粉溶液對羊體嘴部、四肢蹄甲進行噴灑，也可以用84消毒液噴灑。

4、地面消毒：劑量可增加一倍。

5、糞便消毒：最實用的方法是生物熱發酵消毒法，就是把糞便拉到遠離羊場100-200米處，堆積，上面用10厘米的沙土覆蓋發酵，用來產生高溫來殺菌、消毒。在春冬寒冷季節可用化學處理，每200斤糞便中加入百分之15-20的氨水或0.5千克過磷酸鈣拌勻，2-3天就可以消毒滅菌。

6、污水消毒：最常用的方法是把污水引入到污水池，加入漂白粉來進行消毒處理，一般是1升污水用2-5克漂白粉。也可以用自行發酵處理。