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原核微生物主要有放線菌、藍細菌、粘細菌、立克次氏體、支原體、衣原體和螺旋體。
原核生物是指一類細胞核無核膜包裹，只存在稱作核區的裸露DNA的原始單細胞生物。它們都是單細胞原核生物，結構簡單，個體微小，一般為1～10μm，僅為真核細胞的十分之一至萬分之一。
原核生物即廣義的細菌，包括真細菌和古生菌兩大類群，但由于古生菌又具有許多真核生物的特征，明顯區別于細菌，因此不將古生菌列入其中，而將其拿出來單獨描述。具體根據外表特征等方面可以把原核生物分為狹義的細菌、藍細菌、放線菌、支原體、衣原體、螺旋體和立克次氏體七大類。
原核生物仍擁有細胞的基本構造并含有細胞質、細胞壁、細胞膜、以及鞭毛的細胞。細胞壁不包括所有的原核生物，原核生物有一個例外：原核生物中，除了支原體，其余的都有細胞壁；支原體是唯一不具有細胞壁的原核生物。
