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菌種篩選指將從自然界或?qū)嶒?yàn)室保藏的菌株中用不同方法選出具有特殊性能的菌株，如篩選抗生菌時(shí)可用能對(duì)其產(chǎn)生拮抗作用的菌作為篩選對(duì)象進(jìn)行篩選，在篩選能利用烴類(lèi)的菌時(shí)可用僅含烴類(lèi)的培養(yǎng)基進(jìn)行篩選。
從自然界微生物中篩選某菌種的一般步驟是：采集菌樣，富集培養(yǎng)，純種分離，性能測(cè)定。不同微生物的生存環(huán)境不同，獲得理想微生物的第一步是從適合的環(huán)境采集菌樣，然后再按一定的方法分離、純化。
